Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms