Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms