Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssu72Q9CY97 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms