Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mgme1Q9CXC3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mgme1Q9CXC3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mgme1Q9CXC3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mgme1Q9CXC3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mgme1Q9CXC3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mgme1Q9CXC3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mgme1Q9CXC3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mgme1Q9CXC3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mgme1Q9CXC3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mgme1Q9CXC3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mgme1Q9CXC3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms