Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx47Q9CWX9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx47Q9CWX9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx47Q9CWX9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Ddx47Q9CWX9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Ddx47Q9CWX9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ddx47Q9CWX9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ddx47Q9CWX9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ddx47Q9CWX9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ddx47Q9CWX9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ddx47Q9CWX9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ddx47Q9CWX9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ddx47Q9CWX9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ddx47Q9CWX9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx47Q9CWX9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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