Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pin4Q9CWW6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms