Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CWU4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CWU4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CWU4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms