Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pfdn1Q9CWM4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pfdn1Q9CWM4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms