Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms