Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Fcf1Q9CTH6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Fcf1Q9CTH6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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