Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms