Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms