Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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