Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rwdd4Q9CPR1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms