Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms