Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms