Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms