Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pramel1Q99MW3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms