Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstf3Q99LI7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms