Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms