Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms