Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30a1Q99J38 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ttc30a1Q99J38 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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