Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms