Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms