Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms