Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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