Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms