Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf6Q91YR7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms