Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms