Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms