Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms