Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zkscan3Q91VW9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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