Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms