Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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