Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W7

Agr3, Anterior gradient protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agr3Q8R3W7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Agr3Q8R3W7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agr3Q8R3W7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms