Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B7

Brd8, Bromodomain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd8Q8R3B7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd8Q8R3B7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd8Q8R3B7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms