Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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