Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms