Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms