Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1l1Q8CGM2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1l1Q8CGM2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms