Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pramef8Q8CE24 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pramef8Q8CE24 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef8Q8CE24 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms