Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms