Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin52Q8CD94 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms