Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Q8CC96 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Q8CC96 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CC96 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Q8CC96 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Q8CC96 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Q8CC96 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Q8CC96 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Q8CC96 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CC96 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Q8CC96 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CC96 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CC96 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CC96 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Q8CC96 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CC96 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Q8CC96 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CC96 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CC96 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Q8CC96 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CC96 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CC96 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CC96 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CC96 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CC96 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CC96 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CC96 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CC96 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CC96 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CC96 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CC96 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CC96 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CC96 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CC96 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CC96 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms