Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms