Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms