Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6kb1Q8BSK8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6kb1Q8BSK8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6kb1Q8BSK8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6kb1Q8BSK8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6kb1Q8BSK8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6kb1Q8BSK8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6kb1Q8BSK8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6kb1Q8BSK8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6kb1Q8BSK8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6kb1Q8BSK8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6kb1Q8BSK8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6kb1Q8BSK8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms