Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc2Q8BKV1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms