Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra5Q8BHJ7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra5Q8BHJ7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra5Q8BHJ7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra5Q8BHJ7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra5Q8BHJ7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra5Q8BHJ7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms