Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms